2018年7月11日，《Frontiers in Plant Science》杂志在线发表了我校棉花育种团队题为"Identification of SNPs and candidate genes associated with salt tolerance at the seedling stage in cotton (Gossypium hirsutum L.)"的最新研究成果。该文报道了陆地棉苗期耐盐性表型变异以及重要候选基因的鉴定。
通过评价713份陆地棉苗期相对发芽率和耐盐等级2个耐盐相关性状并利用Illumina CottonSNP63K芯片筛选出的10511个SNP位点进行GWAS分析。在A01，A10，D02，D08，D09，D10和D11等7个染色体上共鉴定到23个显著关联的SNP，分别有10个和15个SNP与相对出苗率和耐盐等级2个性状关联。其中，位于D09染色体上的2个SNP（i46598Gh和i47388Gh）同时与两个性状关联。基于显著关联的位点，筛选到280个在盐胁迫下表达的候选基因。这些基因涉及到转录因子、转运蛋白以及激酶等，如NAC，MYB，NXH，WD40，CDPK，LEA和CIPK等均被报道涉及到植物耐盐调控。进一步通过qRT-PCR验证了6个重要候选基因，并发现这些基因在耐盐品种和敏感品种之间存在显著表达差异。该研究为创新棉花耐盐材料提供了理论参考和基因资源。
研究生孙正文和李函利为论文同等贡献第一作者，马峙英教授和王省芬教授为通讯作者。该研究得到国家重点研发计划、河北省科技支撑计划和河北省青年拔尖人才计划资助。
原文链接：https://doi.org/10.3389/fpls.2018.01011
