棉花抗黄萎病相关基因表达分析与基因克隆，国家重大基础研究前期研究专项，2005-2006。
棉花抗黄萎病基因功能鉴定及其抗病机制，973计划前期研究专项，2011-2013。
棉花纤维品质功能基因组研究及优质高产新品种的分子改良，973计划子课题，2010-2015。
棉纤维发育相关基因分析及突变体创造，973计划子课题，2005-2010。
棉花磷高效利用转基因新材料创制和新品系选育，转基因生物新品种培育科技重大专项2009-2010。
国家现代农业产业技术体系棉花遗传改良研究室岗位科学家，农业部，2006-2010。
国家现代农业产业技术体系育种与种子学研究室岗位科学家，农业部，2011-2015。
转基因优质棉花新品种培育，转基因生物新品种培育科技重大专项子课题，2011-2015。
优质转基因棉花新品种选育，转基因生物新品种培育科技重大专项，2008-2010。
高衣分转基因棉花的创建与新品种选育，转基因生物新品种培育科技重大专项，2009-2010。
转基因低酚棉新品种选育，转基因生物新品种培育科技重大专项，2011-2015。
转基因低酚棉新品种选育，转基因生物新品种培育科技重大专项，2008-2010。
棉花品质改良关键基因克隆及功能验证，转基因生物新品种培育科技重大专项，2011-2015。
棉花品质改良关键基因克隆及功能验证，转基因生物新品种培育科技重大专项，2008-2010。
转基因抗虫杂交棉新品种育繁推及产业化，转基因生物新品种培育科技重大专项，2012-2015。
高产优质多抗棉花分子育种与品种创制， 863计划子课题，2012-2015，。
强优势棉花杂交种的创制与应用， 863计划，2009-2010，。
棉花重要性状分子标记与新品种选育，国家高技术研究发展计划子课题，2006-2010。
棉花新品种选育及繁育技术研究，国家高技术研究发展计划子课题，2005-2006。
转基因棉花的黄萎病抗性鉴定与纯系筛选，国家863计划子课题，2006-2010。
杂交棉育种技术研究与新品种选育，国家科技支撑计划子课题，2006-2010。
棉花抗黄萎病基因GbVe的功能鉴定及其抗病机制，国家自然科学基金，2012-2015。
陆地棉谷胱甘肽硫转移酶亚基编码基因GhGST的抗黄萎病功能研究，国家自然科学基金青年基金，2013-2015。
海岛棉水杨酸途径脂肪酶基因GbEDS1抗黄萎病功能及分子机制，国家自然科学基金青年基金，2014-2016。
海岛棉GbHyPRP1基因抗黄萎病功能鉴定及抗病分子机制初探，国家自然科学基金青年基金，2014-2016。
棉花细菌人工染色体文库的构建与分析，国家自然科学基金，2003-2005。
棉纤维次生壁加厚期转录组图谱构建及纤维品质QTLs精细定位，国家自然科学基金，2007-2009。
黄萎病菌胁迫下棉花抗病相关基因表达差异分析，国家自然科学基金，2005-2007。
棉纤维发育次生壁加厚期相关基因克隆与功能研究，国家自然科学基金项目，2009-2011。
棉花抗黄萎病相关基因功能鉴定与表达分析，国家自然科学基金，2009-2011。
棉花黄萎病菌多样性及病害发生模式研究，公益性行业（农业）科研专项经费课题，2007-2010。
高产、优质棉花杂交种“农大棉6号”的中试与示范，农业科技成果转化资金重大项目，2004-2006。
高产、优质、抗病虫棉花新品种“农大棉7号”示范与推广，国家农业科技成果转化资金，2008-2010。
高产、优质、抗病棉花杂交种“农大棉8号”的中试与示范，国家农业科技成果转化资金，2007-2009。
强优势棉花杂交种的创制与应用，863计划子课题，2011-2015。
棉花新材料创制及新品种培育与扩繁，科技部国家科技支撑计划， 2011-2015。
